Nextflow

Nextflowの作者らが設立した Seqera Labsからトレーニングマテリアルが公開されています。まずはこちらを見るのがいいと思います。ただし、Snakemake tutorialとは異なり「Nextflow固有の文法」の説明に主眼が置かれています。

実用例としては https://www.nextflow.io/index.html のメニューバーの”Examples”があります。
また、使える「パターン」が Nextflow Patterns としてまとまっています。

すでに使えるパイプラインを調べたい場合、Nextflowで書かれたワークフローのレポジトリである nf-core で実際に使える様々なパイプラインの実例がリストになっています。